Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms