Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms