Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Gm20538F6Z9R1 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC8.15□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms