Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms