Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmod3E9QA62 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms