Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BC005561E9Q5E2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms