Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Ccdc171E9Q1U1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Ccdc171E9Q1U1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Ccdc171E9Q1U1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Ccdc171E9Q1U1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Ccdc171E9Q1U1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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Ccdc171E9Q1U1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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Ccdc171E9Q1U1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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Ccdc171E9Q1U1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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