Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Lrp3E9Q1T6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms