Protein–RNA interactions for Protein: E9PY60

Vmn1r77, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r77E9PY60 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r77E9PY60 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r77E9PY60 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r77E9PY60 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r77E9PY60 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r77E9PY60 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r77E9PY60 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r77E9PY60 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r77E9PY60 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r77E9PY60 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r77E9PY60 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r77E9PY60 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r77E9PY60 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r77E9PY60 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r77E9PY60 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r77E9PY60 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r77E9PY60 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r77E9PY60 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r77E9PY60 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r77E9PY60 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r77E9PY60 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r77E9PY60 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r77E9PY60 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r77E9PY60 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r77E9PY60 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r77E9PY60 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r77E9PY60 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r77E9PY60 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r77E9PY60 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r77E9PY60 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r77E9PY60 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r77E9PY60 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r77E9PY60 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r77E9PY60 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms