Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srp54bE9PXC0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srp54bE9PXC0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srp54bE9PXC0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srp54bE9PXC0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srp54bE9PXC0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srp54bE9PXC0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srp54bE9PXC0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srp54bE9PXC0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srp54bE9PXC0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Srp54bE9PXC0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srp54bE9PXC0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srp54bE9PXC0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srp54bE9PXC0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srp54bE9PXC0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srp54bE9PXC0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srp54bE9PXC0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srp54bE9PXC0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srp54bE9PXC0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srp54bE9PXC0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srp54bE9PXC0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srp54bE9PXC0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srp54bE9PXC0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srp54bE9PXC0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srp54bE9PXC0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srp54bE9PXC0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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