Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms