Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms