Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm3543D3Z235 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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