Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn24D3YXJ9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms