Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms