Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms