Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms