Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ76

Hmcn2, Hemicentin-2, mousemouse

Predictions only

Length 5,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmcn2A2AJ76 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hmcn2A2AJ76 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms