Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms