Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms