Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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