Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trav12-2A0N8N6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trav12-2A0N8N6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trav12-2A0N8N6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Trav12-2A0N8N6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Trav12-2A0N8N6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Trav12-2A0N8N6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Trav12-2A0N8N6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Trav12-2A0N8N6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Trav12-2A0N8N6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Trav12-2A0N8N6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Trav12-2A0N8N6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Trav12-2A0N8N6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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