Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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