Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gria3Q9Z2W9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gria3Q9Z2W9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gria3Q9Z2W9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gria3Q9Z2W9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gria3Q9Z2W9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gria3Q9Z2W9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gria3Q9Z2W9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gria3Q9Z2W9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gria3Q9Z2W9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gria3Q9Z2W9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gria3Q9Z2W9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gria3Q9Z2W9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gria3Q9Z2W9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gria3Q9Z2W9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gria3Q9Z2W9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gria3Q9Z2W9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gria3Q9Z2W9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gria3Q9Z2W9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gria3Q9Z2W9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gria3Q9Z2W9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gria3Q9Z2W9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gria3Q9Z2W9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gria3Q9Z2W9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gria3Q9Z2W9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gria3Q9Z2W9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gria3Q9Z2W9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gria3Q9Z2W9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gria3Q9Z2W9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gria3Q9Z2W9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gria3Q9Z2W9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gria3Q9Z2W9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gria3Q9Z2W9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gria3Q9Z2W9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gria3Q9Z2W9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gria3Q9Z2W9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gria3Q9Z2W9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gria3Q9Z2W9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gria3Q9Z2W9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gria3Q9Z2W9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gria3Q9Z2W9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gria3Q9Z2W9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gria3Q9Z2W9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gria3Q9Z2W9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gria3Q9Z2W9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gria3Q9Z2W9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gria3Q9Z2W9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gria3Q9Z2W9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gria3Q9Z2W9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gria3Q9Z2W9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gria3Q9Z2W9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gria3Q9Z2W9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gria3Q9Z2W9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gria3Q9Z2W9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gria3Q9Z2W9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gria3Q9Z2W9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gria3Q9Z2W9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gria3Q9Z2W9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gria3Q9Z2W9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gria3Q9Z2W9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gria3Q9Z2W9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gria3Q9Z2W9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gria3Q9Z2W9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gria3Q9Z2W9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gria3Q9Z2W9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gria3Q9Z2W9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gria3Q9Z2W9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gria3Q9Z2W9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gria3Q9Z2W9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gria3Q9Z2W9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gria3Q9Z2W9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gria3Q9Z2W9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gria3Q9Z2W9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gria3Q9Z2W9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gria3Q9Z2W9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gria3Q9Z2W9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gria3Q9Z2W9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gria3Q9Z2W9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gria3Q9Z2W9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gria3Q9Z2W9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gria3Q9Z2W9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gria3Q9Z2W9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gria3Q9Z2W9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gria3Q9Z2W9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gria3Q9Z2W9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gria3Q9Z2W9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gria3Q9Z2W9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gria3Q9Z2W9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gria3Q9Z2W9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gria3Q9Z2W9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gria3Q9Z2W9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gria3Q9Z2W9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gria3Q9Z2W9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gria3Q9Z2W9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gria3Q9Z2W9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gria3Q9Z2W9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gria3Q9Z2W9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gria3Q9Z2W9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gria3Q9Z2W9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gria3Q9Z2W9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.9 ms