Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mbd2Q9Z2E1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mbd2Q9Z2E1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mbd2Q9Z2E1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mbd2Q9Z2E1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mbd2Q9Z2E1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mbd2Q9Z2E1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mbd2Q9Z2E1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd2Q9Z2E1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd2Q9Z2E1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd2Q9Z2E1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd2Q9Z2E1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd2Q9Z2E1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd2Q9Z2E1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd2Q9Z2E1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd2Q9Z2E1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd2Q9Z2E1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd2Q9Z2E1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd2Q9Z2E1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd2Q9Z2E1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd2Q9Z2E1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd2Q9Z2E1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd2Q9Z2E1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mbd2Q9Z2E1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mbd2Q9Z2E1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mbd2Q9Z2E1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mbd2Q9Z2E1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mbd2Q9Z2E1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd2Q9Z2E1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd2Q9Z2E1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mbd2Q9Z2E1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd2Q9Z2E1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd2Q9Z2E1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd2Q9Z2E1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd2Q9Z2E1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd2Q9Z2E1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd2Q9Z2E1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd2Q9Z2E1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd2Q9Z2E1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd2Q9Z2E1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd2Q9Z2E1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd2Q9Z2E1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd2Q9Z2E1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mbd2Q9Z2E1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mbd2Q9Z2E1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd2Q9Z2E1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd2Q9Z2E1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd2Q9Z2E1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd2Q9Z2E1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mbd2Q9Z2E1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mbd2Q9Z2E1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mbd2Q9Z2E1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mbd2Q9Z2E1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd2Q9Z2E1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd2Q9Z2E1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd2Q9Z2E1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd2Q9Z2E1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd2Q9Z2E1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd2Q9Z2E1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd2Q9Z2E1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd2Q9Z2E1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd2Q9Z2E1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd2Q9Z2E1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms