Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ilf3Q9Z1X4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ilf3Q9Z1X4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ilf3Q9Z1X4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ilf3Q9Z1X4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ilf3Q9Z1X4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ilf3Q9Z1X4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ilf3Q9Z1X4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ilf3Q9Z1X4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ilf3Q9Z1X4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ilf3Q9Z1X4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ilf3Q9Z1X4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ilf3Q9Z1X4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ilf3Q9Z1X4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ilf3Q9Z1X4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ilf3Q9Z1X4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ilf3Q9Z1X4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ilf3Q9Z1X4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ilf3Q9Z1X4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ilf3Q9Z1X4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ilf3Q9Z1X4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ilf3Q9Z1X4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ilf3Q9Z1X4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ilf3Q9Z1X4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ilf3Q9Z1X4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ilf3Q9Z1X4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ilf3Q9Z1X4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ilf3Q9Z1X4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ilf3Q9Z1X4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ilf3Q9Z1X4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ilf3Q9Z1X4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ilf3Q9Z1X4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ilf3Q9Z1X4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ilf3Q9Z1X4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ilf3Q9Z1X4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ilf3Q9Z1X4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ilf3Q9Z1X4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ilf3Q9Z1X4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ilf3Q9Z1X4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ilf3Q9Z1X4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ilf3Q9Z1X4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ilf3Q9Z1X4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ilf3Q9Z1X4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ilf3Q9Z1X4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ilf3Q9Z1X4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ilf3Q9Z1X4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ilf3Q9Z1X4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ilf3Q9Z1X4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ilf3Q9Z1X4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ilf3Q9Z1X4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ilf3Q9Z1X4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ilf3Q9Z1X4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ilf3Q9Z1X4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ilf3Q9Z1X4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ilf3Q9Z1X4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ilf3Q9Z1X4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ilf3Q9Z1X4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ilf3Q9Z1X4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ilf3Q9Z1X4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ilf3Q9Z1X4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ilf3Q9Z1X4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ilf3Q9Z1X4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ilf3Q9Z1X4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ilf3Q9Z1X4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ilf3Q9Z1X4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ilf3Q9Z1X4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ilf3Q9Z1X4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ilf3Q9Z1X4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ilf3Q9Z1X4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ilf3Q9Z1X4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ilf3Q9Z1X4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ilf3Q9Z1X4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ilf3Q9Z1X4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ilf3Q9Z1X4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ilf3Q9Z1X4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ilf3Q9Z1X4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ilf3Q9Z1X4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ilf3Q9Z1X4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ilf3Q9Z1X4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ilf3Q9Z1X4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ilf3Q9Z1X4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ilf3Q9Z1X4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ilf3Q9Z1X4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ilf3Q9Z1X4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ilf3Q9Z1X4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ilf3Q9Z1X4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ilf3Q9Z1X4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ilf3Q9Z1X4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ilf3Q9Z1X4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ilf3Q9Z1X4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ilf3Q9Z1X4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ilf3Q9Z1X4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ilf3Q9Z1X4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ilf3Q9Z1X4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ilf3Q9Z1X4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ilf3Q9Z1X4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ilf3Q9Z1X4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ilf3Q9Z1X4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ilf3Q9Z1X4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms