Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Ap3b1Q9Z1T1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Ap3b1Q9Z1T1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC37.7■■■■□ 3.62
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Ap3b1Q9Z1T1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Ap3b1Q9Z1T1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Ap3b1Q9Z1T1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Ap3b1Q9Z1T1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ap3b1Q9Z1T1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ap3b1Q9Z1T1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Ap3b1Q9Z1T1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Ap3b1Q9Z1T1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ap3b1Q9Z1T1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ap3b1Q9Z1T1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Ap3b1Q9Z1T1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Ap3b1Q9Z1T1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Ap3b1Q9Z1T1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Ap3b1Q9Z1T1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Ap3b1Q9Z1T1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Ap3b1Q9Z1T1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Ap3b1Q9Z1T1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ap3b1Q9Z1T1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Ap3b1Q9Z1T1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ap3b1Q9Z1T1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ap3b1Q9Z1T1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Ap3b1Q9Z1T1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Ap3b1Q9Z1T1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Ap3b1Q9Z1T1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Ap3b1Q9Z1T1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
Ap3b1Q9Z1T1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Ap3b1Q9Z1T1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Ap3b1Q9Z1T1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Ap3b1Q9Z1T1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Ap3b1Q9Z1T1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Ap3b1Q9Z1T1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Ap3b1Q9Z1T1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Ap3b1Q9Z1T1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.59
Ap3b1Q9Z1T1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Ap3b1Q9Z1T1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Ap3b1Q9Z1T1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ap3b1Q9Z1T1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Ap3b1Q9Z1T1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Ap3b1Q9Z1T1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Ap3b1Q9Z1T1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Ap3b1Q9Z1T1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Ap3b1Q9Z1T1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC37.38■■■■□ 3.58
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
Ap3b1Q9Z1T1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Ap3b1Q9Z1T1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Ap3b1Q9Z1T1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Ap3b1Q9Z1T1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
Ap3b1Q9Z1T1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Ap3b1Q9Z1T1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Ap3b1Q9Z1T1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Ap3b1Q9Z1T1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Ap3b1Q9Z1T1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Ap3b1Q9Z1T1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Ap3b1Q9Z1T1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Ap3b1Q9Z1T1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Ap3b1Q9Z1T1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Ap3b1Q9Z1T1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ap3b1Q9Z1T1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ap3b1Q9Z1T1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
Ap3b1Q9Z1T1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Ap3b1Q9Z1T1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Ap3b1Q9Z1T1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Ap3b1Q9Z1T1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ap3b1Q9Z1T1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ap3b1Q9Z1T1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ap3b1Q9Z1T1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ap3b1Q9Z1T1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ap3b1Q9Z1T1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ap3b1Q9Z1T1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ap3b1Q9Z1T1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Ap3b1Q9Z1T1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Ap3b1Q9Z1T1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Ap3b1Q9Z1T1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
Ap3b1Q9Z1T1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Ap3b1Q9Z1T1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
Ap3b1Q9Z1T1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Ap3b1Q9Z1T1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Ap3b1Q9Z1T1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
Ap3b1Q9Z1T1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Ap3b1Q9Z1T1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
Ap3b1Q9Z1T1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ap3b1Q9Z1T1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ap3b1Q9Z1T1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms