Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Nup160Q9Z0W3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Nup160Q9Z0W3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Nup160Q9Z0W3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
Nup160Q9Z0W3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Nup160Q9Z0W3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Nup160Q9Z0W3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Nup160Q9Z0W3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Nup160Q9Z0W3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Nup160Q9Z0W3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
Nup160Q9Z0W3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
Nup160Q9Z0W3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Nup160Q9Z0W3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
Nup160Q9Z0W3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Nup160Q9Z0W3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Nup160Q9Z0W3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Nup160Q9Z0W3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Nup160Q9Z0W3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Nup160Q9Z0W3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Nup160Q9Z0W3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
Nup160Q9Z0W3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
Nup160Q9Z0W3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Nup160Q9Z0W3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC39.39■■■■□ 3.9
Nup160Q9Z0W3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC39.39■■■■□ 3.9
Nup160Q9Z0W3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC39.39■■■■□ 3.9
Nup160Q9Z0W3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
Nup160Q9Z0W3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Nup160Q9Z0W3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Nup160Q9Z0W3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
Nup160Q9Z0W3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
Nup160Q9Z0W3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Nup160Q9Z0W3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
Nup160Q9Z0W3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
Nup160Q9Z0W3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Nup160Q9Z0W3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Nup160Q9Z0W3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Nup160Q9Z0W3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Nup160Q9Z0W3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Nup160Q9Z0W3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Nup160Q9Z0W3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Nup160Q9Z0W3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
Nup160Q9Z0W3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
Nup160Q9Z0W3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Nup160Q9Z0W3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
Nup160Q9Z0W3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Nup160Q9Z0W3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Nup160Q9Z0W3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Nup160Q9Z0W3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
Nup160Q9Z0W3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Nup160Q9Z0W3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Nup160Q9Z0W3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Nup160Q9Z0W3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Nup160Q9Z0W3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Nup160Q9Z0W3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Nup160Q9Z0W3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
Nup160Q9Z0W3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Nup160Q9Z0W3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
Nup160Q9Z0W3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Nup160Q9Z0W3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Nup160Q9Z0W3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Nup160Q9Z0W3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
Nup160Q9Z0W3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Nup160Q9Z0W3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Nup160Q9Z0W3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
Nup160Q9Z0W3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Nup160Q9Z0W3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
Nup160Q9Z0W3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Nup160Q9Z0W3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Nup160Q9Z0W3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Nup160Q9Z0W3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Nup160Q9Z0W3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
Nup160Q9Z0W3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Nup160Q9Z0W3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Nup160Q9Z0W3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
Nup160Q9Z0W3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Nup160Q9Z0W3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Nup160Q9Z0W3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
Nup160Q9Z0W3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
Nup160Q9Z0W3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Nup160Q9Z0W3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Nup160Q9Z0W3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Nup160Q9Z0W3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC39■■■■□ 3.83
Nup160Q9Z0W3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Nup160Q9Z0W3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Nup160Q9Z0W3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Nup160Q9Z0W3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Nup160Q9Z0W3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Nup160Q9Z0W3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Nup160Q9Z0W3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Nup160Q9Z0W3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Nup160Q9Z0W3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Nup160Q9Z0W3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Nup160Q9Z0W3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Nup160Q9Z0W3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Nup160Q9Z0W3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Nup160Q9Z0W3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Nup160Q9Z0W3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Nup160Q9Z0W3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
Nup160Q9Z0W3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Nup160Q9Z0W3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms