Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ptpn4Q9WU22 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ptpn4Q9WU22 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ptpn4Q9WU22 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn4Q9WU22 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn4Q9WU22 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn4Q9WU22 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn4Q9WU22 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn4Q9WU22 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn4Q9WU22 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn4Q9WU22 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn4Q9WU22 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn4Q9WU22 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn4Q9WU22 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn4Q9WU22 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn4Q9WU22 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn4Q9WU22 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn4Q9WU22 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn4Q9WU22 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn4Q9WU22 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn4Q9WU22 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn4Q9WU22 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn4Q9WU22 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn4Q9WU22 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn4Q9WU22 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpn4Q9WU22 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpn4Q9WU22 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpn4Q9WU22 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpn4Q9WU22 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpn4Q9WU22 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn4Q9WU22 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn4Q9WU22 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn4Q9WU22 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn4Q9WU22 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpn4Q9WU22 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpn4Q9WU22 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpn4Q9WU22 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn4Q9WU22 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpn4Q9WU22 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpn4Q9WU22 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpn4Q9WU22 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn4Q9WU22 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn4Q9WU22 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn4Q9WU22 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn4Q9WU22 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpn4Q9WU22 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpn4Q9WU22 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpn4Q9WU22 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpn4Q9WU22 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn4Q9WU22 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn4Q9WU22 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn4Q9WU22 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpn4Q9WU22 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpn4Q9WU22 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn4Q9WU22 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn4Q9WU22 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn4Q9WU22 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn4Q9WU22 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn4Q9WU22 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn4Q9WU22 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn4Q9WU22 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ptpn4Q9WU22 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ptpn4Q9WU22 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn4Q9WU22 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn4Q9WU22 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn4Q9WU22 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn4Q9WU22 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn4Q9WU22 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn4Q9WU22 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn4Q9WU22 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn4Q9WU22 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn4Q9WU22 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn4Q9WU22 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn4Q9WU22 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpn4Q9WU22 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpn4Q9WU22 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn4Q9WU22 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn4Q9WU22 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn4Q9WU22 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn4Q9WU22 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn4Q9WU22 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn4Q9WU22 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn4Q9WU22 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn4Q9WU22 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptpn4Q9WU22 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptpn4Q9WU22 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptpn4Q9WU22 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptpn4Q9WU22 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ptpn4Q9WU22 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn4Q9WU22 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn4Q9WU22 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn4Q9WU22 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn4Q9WU22 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpn4Q9WU22 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpn4Q9WU22 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpn4Q9WU22 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn4Q9WU22 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn4Q9WU22 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn4Q9WU22 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn4Q9WU22 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms