Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTY1

Pdcd7, Programmed cell death protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd7Q9WTY1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd7Q9WTY1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd7Q9WTY1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcd7Q9WTY1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcd7Q9WTY1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcd7Q9WTY1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcd7Q9WTY1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pdcd7Q9WTY1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcd7Q9WTY1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd7Q9WTY1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd7Q9WTY1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd7Q9WTY1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd7Q9WTY1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd7Q9WTY1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdcd7Q9WTY1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcd7Q9WTY1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcd7Q9WTY1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcd7Q9WTY1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcd7Q9WTY1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcd7Q9WTY1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdcd7Q9WTY1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdcd7Q9WTY1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdcd7Q9WTY1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcd7Q9WTY1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcd7Q9WTY1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcd7Q9WTY1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdcd7Q9WTY1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdcd7Q9WTY1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdcd7Q9WTY1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdcd7Q9WTY1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdcd7Q9WTY1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdcd7Q9WTY1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdcd7Q9WTY1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdcd7Q9WTY1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdcd7Q9WTY1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdcd7Q9WTY1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdcd7Q9WTY1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdcd7Q9WTY1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdcd7Q9WTY1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdcd7Q9WTY1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdcd7Q9WTY1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pdcd7Q9WTY1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdcd7Q9WTY1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdcd7Q9WTY1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdcd7Q9WTY1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdcd7Q9WTY1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdcd7Q9WTY1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdcd7Q9WTY1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdcd7Q9WTY1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdcd7Q9WTY1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdcd7Q9WTY1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdcd7Q9WTY1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdcd7Q9WTY1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdcd7Q9WTY1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdcd7Q9WTY1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdcd7Q9WTY1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdcd7Q9WTY1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdcd7Q9WTY1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdcd7Q9WTY1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdcd7Q9WTY1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdcd7Q9WTY1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdcd7Q9WTY1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdcd7Q9WTY1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdcd7Q9WTY1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdcd7Q9WTY1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdcd7Q9WTY1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdcd7Q9WTY1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdcd7Q9WTY1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdcd7Q9WTY1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdcd7Q9WTY1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdcd7Q9WTY1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdcd7Q9WTY1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdcd7Q9WTY1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdcd7Q9WTY1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdcd7Q9WTY1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdcd7Q9WTY1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdcd7Q9WTY1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdcd7Q9WTY1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdcd7Q9WTY1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdcd7Q9WTY1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdcd7Q9WTY1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdcd7Q9WTY1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdcd7Q9WTY1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcd7Q9WTY1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcd7Q9WTY1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcd7Q9WTY1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pdcd7Q9WTY1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdcd7Q9WTY1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdcd7Q9WTY1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcd7Q9WTY1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcd7Q9WTY1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcd7Q9WTY1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcd7Q9WTY1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcd7Q9WTY1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcd7Q9WTY1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcd7Q9WTY1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcd7Q9WTY1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcd7Q9WTY1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcd7Q9WTY1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcd7Q9WTY1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms