Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp18Q9WTV6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp18Q9WTV6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp18Q9WTV6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp18Q9WTV6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp18Q9WTV6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp18Q9WTV6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp18Q9WTV6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp18Q9WTV6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp18Q9WTV6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp18Q9WTV6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp18Q9WTV6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp18Q9WTV6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp18Q9WTV6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp18Q9WTV6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp18Q9WTV6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp18Q9WTV6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp18Q9WTV6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp18Q9WTV6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp18Q9WTV6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp18Q9WTV6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp18Q9WTV6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp18Q9WTV6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp18Q9WTV6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp18Q9WTV6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp18Q9WTV6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp18Q9WTV6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp18Q9WTV6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp18Q9WTV6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp18Q9WTV6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp18Q9WTV6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp18Q9WTV6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp18Q9WTV6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp18Q9WTV6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp18Q9WTV6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp18Q9WTV6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp18Q9WTV6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp18Q9WTV6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp18Q9WTV6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp18Q9WTV6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp18Q9WTV6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp18Q9WTV6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp18Q9WTV6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp18Q9WTV6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp18Q9WTV6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp18Q9WTV6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp18Q9WTV6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp18Q9WTV6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp18Q9WTV6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp18Q9WTV6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp18Q9WTV6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp18Q9WTV6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp18Q9WTV6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp18Q9WTV6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp18Q9WTV6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp18Q9WTV6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp18Q9WTV6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp18Q9WTV6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp18Q9WTV6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp18Q9WTV6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp18Q9WTV6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp18Q9WTV6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp18Q9WTV6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp18Q9WTV6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp18Q9WTV6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp18Q9WTV6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp18Q9WTV6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp18Q9WTV6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp18Q9WTV6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp18Q9WTV6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp18Q9WTV6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp18Q9WTV6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp18Q9WTV6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp18Q9WTV6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp18Q9WTV6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp18Q9WTV6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp18Q9WTV6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp18Q9WTV6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp18Q9WTV6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp18Q9WTV6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp18Q9WTV6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp18Q9WTV6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp18Q9WTV6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp18Q9WTV6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp18Q9WTV6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp18Q9WTV6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp18Q9WTV6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp18Q9WTV6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp18Q9WTV6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp18Q9WTV6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp18Q9WTV6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp18Q9WTV6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp18Q9WTV6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp18Q9WTV6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp18Q9WTV6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp18Q9WTV6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp18Q9WTV6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp18Q9WTV6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp18Q9WTV6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp18Q9WTV6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms