Protein–RNA interactions for Protein: Q9R210

Tfeb, Transcription factor EB, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfebQ9R210 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TfebQ9R210 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TfebQ9R210 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TfebQ9R210 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TfebQ9R210 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TfebQ9R210 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TfebQ9R210 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TfebQ9R210 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TfebQ9R210 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TfebQ9R210 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TfebQ9R210 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TfebQ9R210 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TfebQ9R210 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TfebQ9R210 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TfebQ9R210 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TfebQ9R210 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TfebQ9R210 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TfebQ9R210 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TfebQ9R210 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TfebQ9R210 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TfebQ9R210 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TfebQ9R210 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TfebQ9R210 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TfebQ9R210 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TfebQ9R210 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TfebQ9R210 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TfebQ9R210 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TfebQ9R210 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TfebQ9R210 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TfebQ9R210 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TfebQ9R210 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TfebQ9R210 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TfebQ9R210 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TfebQ9R210 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TfebQ9R210 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TfebQ9R210 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TfebQ9R210 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TfebQ9R210 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TfebQ9R210 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TfebQ9R210 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TfebQ9R210 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TfebQ9R210 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TfebQ9R210 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TfebQ9R210 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TfebQ9R210 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TfebQ9R210 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TfebQ9R210 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TfebQ9R210 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TfebQ9R210 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TfebQ9R210 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TfebQ9R210 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TfebQ9R210 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TfebQ9R210 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TfebQ9R210 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TfebQ9R210 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TfebQ9R210 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TfebQ9R210 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TfebQ9R210 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TfebQ9R210 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TfebQ9R210 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TfebQ9R210 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TfebQ9R210 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TfebQ9R210 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TfebQ9R210 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TfebQ9R210 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TfebQ9R210 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TfebQ9R210 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TfebQ9R210 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TfebQ9R210 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TfebQ9R210 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TfebQ9R210 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TfebQ9R210 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TfebQ9R210 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TfebQ9R210 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TfebQ9R210 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TfebQ9R210 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TfebQ9R210 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TfebQ9R210 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TfebQ9R210 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TfebQ9R210 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TfebQ9R210 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TfebQ9R210 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TfebQ9R210 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TfebQ9R210 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TfebQ9R210 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TfebQ9R210 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TfebQ9R210 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TfebQ9R210 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TfebQ9R210 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TfebQ9R210 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TfebQ9R210 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TfebQ9R210 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TfebQ9R210 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TfebQ9R210 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TfebQ9R210 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TfebQ9R210 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TfebQ9R210 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TfebQ9R210 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TfebQ9R210 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TfebQ9R210 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms