Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N5

Syt5, Synaptotagmin-5, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt5Q9R0N5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Syt5Q9R0N5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Syt5Q9R0N5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Syt5Q9R0N5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Syt5Q9R0N5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Syt5Q9R0N5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Syt5Q9R0N5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Syt5Q9R0N5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Syt5Q9R0N5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Syt5Q9R0N5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Syt5Q9R0N5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Syt5Q9R0N5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Syt5Q9R0N5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Syt5Q9R0N5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Syt5Q9R0N5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Syt5Q9R0N5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Syt5Q9R0N5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Syt5Q9R0N5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Syt5Q9R0N5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Syt5Q9R0N5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Syt5Q9R0N5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Syt5Q9R0N5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Syt5Q9R0N5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Syt5Q9R0N5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Syt5Q9R0N5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Syt5Q9R0N5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Syt5Q9R0N5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Syt5Q9R0N5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Syt5Q9R0N5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Syt5Q9R0N5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Syt5Q9R0N5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Syt5Q9R0N5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Syt5Q9R0N5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Syt5Q9R0N5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Syt5Q9R0N5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Syt5Q9R0N5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Syt5Q9R0N5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Syt5Q9R0N5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Syt5Q9R0N5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Syt5Q9R0N5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Syt5Q9R0N5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Syt5Q9R0N5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Syt5Q9R0N5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Syt5Q9R0N5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Syt5Q9R0N5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Syt5Q9R0N5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Syt5Q9R0N5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Syt5Q9R0N5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Syt5Q9R0N5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Syt5Q9R0N5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Syt5Q9R0N5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Syt5Q9R0N5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Syt5Q9R0N5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Syt5Q9R0N5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Syt5Q9R0N5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Syt5Q9R0N5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Syt5Q9R0N5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Syt5Q9R0N5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Syt5Q9R0N5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Syt5Q9R0N5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Syt5Q9R0N5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Syt5Q9R0N5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Syt5Q9R0N5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Syt5Q9R0N5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Syt5Q9R0N5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Syt5Q9R0N5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Syt5Q9R0N5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Syt5Q9R0N5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Syt5Q9R0N5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Syt5Q9R0N5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Syt5Q9R0N5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Syt5Q9R0N5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Syt5Q9R0N5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Syt5Q9R0N5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Syt5Q9R0N5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Syt5Q9R0N5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Syt5Q9R0N5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Syt5Q9R0N5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Syt5Q9R0N5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Syt5Q9R0N5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Syt5Q9R0N5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Syt5Q9R0N5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Syt5Q9R0N5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Syt5Q9R0N5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Syt5Q9R0N5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Syt5Q9R0N5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Syt5Q9R0N5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Syt5Q9R0N5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Syt5Q9R0N5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Syt5Q9R0N5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Syt5Q9R0N5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Syt5Q9R0N5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Syt5Q9R0N5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Syt5Q9R0N5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Syt5Q9R0N5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Syt5Q9R0N5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Syt5Q9R0N5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Syt5Q9R0N5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Syt5Q9R0N5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Syt5Q9R0N5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms