Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcm1Q9R0L6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcm1Q9R0L6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcm1Q9R0L6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcm1Q9R0L6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcm1Q9R0L6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcm1Q9R0L6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcm1Q9R0L6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcm1Q9R0L6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcm1Q9R0L6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcm1Q9R0L6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcm1Q9R0L6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcm1Q9R0L6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcm1Q9R0L6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcm1Q9R0L6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcm1Q9R0L6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcm1Q9R0L6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcm1Q9R0L6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcm1Q9R0L6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcm1Q9R0L6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcm1Q9R0L6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pcm1Q9R0L6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcm1Q9R0L6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcm1Q9R0L6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcm1Q9R0L6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcm1Q9R0L6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcm1Q9R0L6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcm1Q9R0L6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcm1Q9R0L6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcm1Q9R0L6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcm1Q9R0L6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcm1Q9R0L6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcm1Q9R0L6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcm1Q9R0L6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcm1Q9R0L6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcm1Q9R0L6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcm1Q9R0L6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcm1Q9R0L6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcm1Q9R0L6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcm1Q9R0L6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcm1Q9R0L6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcm1Q9R0L6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcm1Q9R0L6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcm1Q9R0L6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcm1Q9R0L6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcm1Q9R0L6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcm1Q9R0L6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcm1Q9R0L6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcm1Q9R0L6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcm1Q9R0L6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcm1Q9R0L6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcm1Q9R0L6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcm1Q9R0L6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcm1Q9R0L6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcm1Q9R0L6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcm1Q9R0L6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcm1Q9R0L6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcm1Q9R0L6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcm1Q9R0L6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcm1Q9R0L6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcm1Q9R0L6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcm1Q9R0L6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcm1Q9R0L6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcm1Q9R0L6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcm1Q9R0L6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcm1Q9R0L6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcm1Q9R0L6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcm1Q9R0L6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcm1Q9R0L6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcm1Q9R0L6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcm1Q9R0L6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcm1Q9R0L6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcm1Q9R0L6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcm1Q9R0L6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcm1Q9R0L6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcm1Q9R0L6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcm1Q9R0L6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pcm1Q9R0L6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Pcm1Q9R0L6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcm1Q9R0L6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcm1Q9R0L6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcm1Q9R0L6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcm1Q9R0L6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcm1Q9R0L6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcm1Q9R0L6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcm1Q9R0L6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcm1Q9R0L6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcm1Q9R0L6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcm1Q9R0L6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcm1Q9R0L6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcm1Q9R0L6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcm1Q9R0L6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcm1Q9R0L6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcm1Q9R0L6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcm1Q9R0L6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcm1Q9R0L6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcm1Q9R0L6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcm1Q9R0L6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcm1Q9R0L6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcm1Q9R0L6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms