Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpc6Q9R087 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpc6Q9R087 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpc6Q9R087 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpc6Q9R087 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpc6Q9R087 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpc6Q9R087 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpc6Q9R087 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpc6Q9R087 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpc6Q9R087 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpc6Q9R087 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpc6Q9R087 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpc6Q9R087 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpc6Q9R087 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpc6Q9R087 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc6Q9R087 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc6Q9R087 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpc6Q9R087 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpc6Q9R087 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpc6Q9R087 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpc6Q9R087 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpc6Q9R087 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpc6Q9R087 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpc6Q9R087 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpc6Q9R087 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpc6Q9R087 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gpc6Q9R087 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gpc6Q9R087 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpc6Q9R087 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpc6Q9R087 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpc6Q9R087 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpc6Q9R087 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpc6Q9R087 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpc6Q9R087 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpc6Q9R087 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpc6Q9R087 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpc6Q9R087 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpc6Q9R087 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpc6Q9R087 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpc6Q9R087 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpc6Q9R087 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpc6Q9R087 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpc6Q9R087 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpc6Q9R087 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpc6Q9R087 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpc6Q9R087 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpc6Q9R087 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpc6Q9R087 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Gpc6Q9R087 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpc6Q9R087 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpc6Q9R087 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpc6Q9R087 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpc6Q9R087 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpc6Q9R087 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpc6Q9R087 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gpc6Q9R087 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpc6Q9R087 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpc6Q9R087 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpc6Q9R087 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpc6Q9R087 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpc6Q9R087 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpc6Q9R087 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Gpc6Q9R087 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpc6Q9R087 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpc6Q9R087 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpc6Q9R087 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpc6Q9R087 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpc6Q9R087 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpc6Q9R087 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpc6Q9R087 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpc6Q9R087 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpc6Q9R087 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpc6Q9R087 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpc6Q9R087 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpc6Q9R087 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpc6Q9R087 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpc6Q9R087 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpc6Q9R087 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpc6Q9R087 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpc6Q9R087 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpc6Q9R087 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpc6Q9R087 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpc6Q9R087 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpc6Q9R087 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpc6Q9R087 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpc6Q9R087 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpc6Q9R087 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpc6Q9R087 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpc6Q9R087 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpc6Q9R087 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpc6Q9R087 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpc6Q9R087 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpc6Q9R087 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpc6Q9R087 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpc6Q9R087 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpc6Q9R087 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpc6Q9R087 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpc6Q9R087 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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