Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW9

Slc7a8, Large neutral amino acids transporter small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a8Q9QXW9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc7a8Q9QXW9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc7a8Q9QXW9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc7a8Q9QXW9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc7a8Q9QXW9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc7a8Q9QXW9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc7a8Q9QXW9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc7a8Q9QXW9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc7a8Q9QXW9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc7a8Q9QXW9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc7a8Q9QXW9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc7a8Q9QXW9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc7a8Q9QXW9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc7a8Q9QXW9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc7a8Q9QXW9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc7a8Q9QXW9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc7a8Q9QXW9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc7a8Q9QXW9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc7a8Q9QXW9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc7a8Q9QXW9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc7a8Q9QXW9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc7a8Q9QXW9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc7a8Q9QXW9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc7a8Q9QXW9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc7a8Q9QXW9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc7a8Q9QXW9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc7a8Q9QXW9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc7a8Q9QXW9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc7a8Q9QXW9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc7a8Q9QXW9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc7a8Q9QXW9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc7a8Q9QXW9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc7a8Q9QXW9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc7a8Q9QXW9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc7a8Q9QXW9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc7a8Q9QXW9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc7a8Q9QXW9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc7a8Q9QXW9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc7a8Q9QXW9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc7a8Q9QXW9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc7a8Q9QXW9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc7a8Q9QXW9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc7a8Q9QXW9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc7a8Q9QXW9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc7a8Q9QXW9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc7a8Q9QXW9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc7a8Q9QXW9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc7a8Q9QXW9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc7a8Q9QXW9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc7a8Q9QXW9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc7a8Q9QXW9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc7a8Q9QXW9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc7a8Q9QXW9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc7a8Q9QXW9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc7a8Q9QXW9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc7a8Q9QXW9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc7a8Q9QXW9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc7a8Q9QXW9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc7a8Q9QXW9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc7a8Q9QXW9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc7a8Q9QXW9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc7a8Q9QXW9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc7a8Q9QXW9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc7a8Q9QXW9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc7a8Q9QXW9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc7a8Q9QXW9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc7a8Q9QXW9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc7a8Q9QXW9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc7a8Q9QXW9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc7a8Q9QXW9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc7a8Q9QXW9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc7a8Q9QXW9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc7a8Q9QXW9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc7a8Q9QXW9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc7a8Q9QXW9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc7a8Q9QXW9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc7a8Q9QXW9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc7a8Q9QXW9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc7a8Q9QXW9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc7a8Q9QXW9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc7a8Q9QXW9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc7a8Q9QXW9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc7a8Q9QXW9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc7a8Q9QXW9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc7a8Q9QXW9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc7a8Q9QXW9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc7a8Q9QXW9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc7a8Q9QXW9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc7a8Q9QXW9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc7a8Q9QXW9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc7a8Q9QXW9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc7a8Q9QXW9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc7a8Q9QXW9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc7a8Q9QXW9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc7a8Q9QXW9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc7a8Q9QXW9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc7a8Q9QXW9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc7a8Q9QXW9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc7a8Q9QXW9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc7a8Q9QXW9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms