Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc2lQ9JME7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc2lQ9JME7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc2lQ9JME7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc2lQ9JME7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc2lQ9JME7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc2lQ9JME7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc2lQ9JME7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc2lQ9JME7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc2lQ9JME7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc2lQ9JME7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc2lQ9JME7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc2lQ9JME7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc2lQ9JME7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc2lQ9JME7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc2lQ9JME7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc2lQ9JME7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc2lQ9JME7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc2lQ9JME7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc2lQ9JME7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc2lQ9JME7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc2lQ9JME7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc2lQ9JME7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc2lQ9JME7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc2lQ9JME7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc2lQ9JME7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc2lQ9JME7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc2lQ9JME7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc2lQ9JME7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc2lQ9JME7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc2lQ9JME7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc2lQ9JME7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc2lQ9JME7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc2lQ9JME7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc2lQ9JME7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc2lQ9JME7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc2lQ9JME7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc2lQ9JME7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc2lQ9JME7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc2lQ9JME7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc2lQ9JME7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc2lQ9JME7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc2lQ9JME7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc2lQ9JME7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc2lQ9JME7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc2lQ9JME7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc2lQ9JME7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc2lQ9JME7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc2lQ9JME7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc2lQ9JME7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc2lQ9JME7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc2lQ9JME7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc2lQ9JME7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc2lQ9JME7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc2lQ9JME7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc2lQ9JME7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc2lQ9JME7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc2lQ9JME7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc2lQ9JME7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc2lQ9JME7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc2lQ9JME7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc2lQ9JME7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc2lQ9JME7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc2lQ9JME7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc2lQ9JME7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc2lQ9JME7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc2lQ9JME7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc2lQ9JME7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc2lQ9JME7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc2lQ9JME7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms