Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ59

Abcb9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb9Q9JJ59 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb9Q9JJ59 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb9Q9JJ59 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb9Q9JJ59 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb9Q9JJ59 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb9Q9JJ59 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcb9Q9JJ59 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcb9Q9JJ59 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcb9Q9JJ59 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcb9Q9JJ59 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcb9Q9JJ59 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcb9Q9JJ59 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcb9Q9JJ59 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcb9Q9JJ59 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcb9Q9JJ59 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcb9Q9JJ59 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcb9Q9JJ59 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcb9Q9JJ59 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcb9Q9JJ59 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcb9Q9JJ59 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcb9Q9JJ59 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcb9Q9JJ59 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcb9Q9JJ59 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcb9Q9JJ59 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcb9Q9JJ59 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcb9Q9JJ59 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcb9Q9JJ59 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcb9Q9JJ59 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcb9Q9JJ59 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcb9Q9JJ59 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcb9Q9JJ59 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcb9Q9JJ59 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcb9Q9JJ59 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcb9Q9JJ59 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcb9Q9JJ59 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcb9Q9JJ59 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcb9Q9JJ59 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcb9Q9JJ59 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcb9Q9JJ59 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcb9Q9JJ59 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcb9Q9JJ59 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcb9Q9JJ59 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcb9Q9JJ59 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcb9Q9JJ59 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcb9Q9JJ59 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcb9Q9JJ59 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcb9Q9JJ59 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcb9Q9JJ59 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcb9Q9JJ59 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcb9Q9JJ59 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Abcb9Q9JJ59 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Abcb9Q9JJ59 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb9Q9JJ59 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb9Q9JJ59 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb9Q9JJ59 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcb9Q9JJ59 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcb9Q9JJ59 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcb9Q9JJ59 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcb9Q9JJ59 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcb9Q9JJ59 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcb9Q9JJ59 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb9Q9JJ59 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb9Q9JJ59 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb9Q9JJ59 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcb9Q9JJ59 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcb9Q9JJ59 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb9Q9JJ59 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb9Q9JJ59 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb9Q9JJ59 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb9Q9JJ59 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb9Q9JJ59 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb9Q9JJ59 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb9Q9JJ59 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb9Q9JJ59 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb9Q9JJ59 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb9Q9JJ59 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb9Q9JJ59 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb9Q9JJ59 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb9Q9JJ59 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb9Q9JJ59 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb9Q9JJ59 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb9Q9JJ59 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb9Q9JJ59 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb9Q9JJ59 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb9Q9JJ59 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb9Q9JJ59 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb9Q9JJ59 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb9Q9JJ59 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb9Q9JJ59 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb9Q9JJ59 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb9Q9JJ59 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb9Q9JJ59 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb9Q9JJ59 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb9Q9JJ59 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Abcb9Q9JJ59 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcb9Q9JJ59 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcb9Q9JJ59 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcb9Q9JJ59 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcb9Q9JJ59 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcb9Q9JJ59 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms