Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ropn1Q9ESG2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ropn1Q9ESG2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ropn1Q9ESG2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ropn1Q9ESG2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ropn1Q9ESG2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ropn1Q9ESG2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ropn1Q9ESG2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ropn1Q9ESG2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ropn1Q9ESG2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ropn1Q9ESG2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ropn1Q9ESG2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ropn1Q9ESG2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ropn1Q9ESG2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ropn1Q9ESG2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ropn1Q9ESG2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ropn1Q9ESG2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ropn1Q9ESG2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ropn1Q9ESG2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ropn1Q9ESG2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ropn1Q9ESG2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ropn1Q9ESG2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ropn1Q9ESG2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ropn1Q9ESG2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ropn1Q9ESG2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ropn1Q9ESG2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ropn1Q9ESG2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ropn1Q9ESG2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ropn1Q9ESG2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ropn1Q9ESG2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ropn1Q9ESG2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ropn1Q9ESG2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ropn1Q9ESG2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ropn1Q9ESG2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ropn1Q9ESG2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ropn1Q9ESG2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ropn1Q9ESG2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ropn1Q9ESG2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ropn1Q9ESG2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ropn1Q9ESG2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ropn1Q9ESG2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ropn1Q9ESG2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ropn1Q9ESG2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ropn1Q9ESG2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ropn1Q9ESG2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ropn1Q9ESG2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ropn1Q9ESG2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ropn1Q9ESG2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ropn1Q9ESG2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ropn1Q9ESG2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ropn1Q9ESG2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ropn1Q9ESG2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ropn1Q9ESG2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ropn1Q9ESG2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ropn1Q9ESG2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ropn1Q9ESG2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ropn1Q9ESG2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ropn1Q9ESG2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ropn1Q9ESG2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ropn1Q9ESG2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ropn1Q9ESG2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ropn1Q9ESG2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ropn1Q9ESG2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ropn1Q9ESG2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ropn1Q9ESG2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ropn1Q9ESG2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ropn1Q9ESG2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ropn1Q9ESG2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ropn1Q9ESG2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ropn1Q9ESG2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ropn1Q9ESG2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ropn1Q9ESG2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ropn1Q9ESG2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ropn1Q9ESG2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ropn1Q9ESG2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ropn1Q9ESG2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ropn1Q9ESG2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ropn1Q9ESG2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ropn1Q9ESG2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ropn1Q9ESG2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ropn1Q9ESG2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ropn1Q9ESG2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ropn1Q9ESG2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ropn1Q9ESG2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ropn1Q9ESG2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ropn1Q9ESG2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ropn1Q9ESG2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ropn1Q9ESG2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ropn1Q9ESG2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ropn1Q9ESG2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ropn1Q9ESG2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ropn1Q9ESG2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ropn1Q9ESG2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ropn1Q9ESG2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ropn1Q9ESG2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ropn1Q9ESG2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ropn1Q9ESG2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ropn1Q9ESG2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ropn1Q9ESG2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ropn1Q9ESG2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms