Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES97

Rtn3, Reticulon-3, mousemouse

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Length 964 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn3Q9ES97 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rtn3Q9ES97 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtn3Q9ES97 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rtn3Q9ES97 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtn3Q9ES97 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtn3Q9ES97 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtn3Q9ES97 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtn3Q9ES97 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtn3Q9ES97 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtn3Q9ES97 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtn3Q9ES97 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtn3Q9ES97 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtn3Q9ES97 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtn3Q9ES97 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtn3Q9ES97 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtn3Q9ES97 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtn3Q9ES97 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtn3Q9ES97 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtn3Q9ES97 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtn3Q9ES97 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtn3Q9ES97 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtn3Q9ES97 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtn3Q9ES97 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtn3Q9ES97 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtn3Q9ES97 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtn3Q9ES97 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtn3Q9ES97 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtn3Q9ES97 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtn3Q9ES97 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtn3Q9ES97 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtn3Q9ES97 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtn3Q9ES97 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtn3Q9ES97 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtn3Q9ES97 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtn3Q9ES97 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtn3Q9ES97 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rtn3Q9ES97 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtn3Q9ES97 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtn3Q9ES97 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtn3Q9ES97 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtn3Q9ES97 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtn3Q9ES97 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rtn3Q9ES97 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rtn3Q9ES97 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rtn3Q9ES97 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtn3Q9ES97 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtn3Q9ES97 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtn3Q9ES97 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtn3Q9ES97 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rtn3Q9ES97 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rtn3Q9ES97 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rtn3Q9ES97 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rtn3Q9ES97 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtn3Q9ES97 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtn3Q9ES97 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtn3Q9ES97 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtn3Q9ES97 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtn3Q9ES97 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtn3Q9ES97 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtn3Q9ES97 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtn3Q9ES97 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtn3Q9ES97 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtn3Q9ES97 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtn3Q9ES97 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtn3Q9ES97 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtn3Q9ES97 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rtn3Q9ES97 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtn3Q9ES97 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtn3Q9ES97 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtn3Q9ES97 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtn3Q9ES97 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtn3Q9ES97 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtn3Q9ES97 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtn3Q9ES97 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtn3Q9ES97 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtn3Q9ES97 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtn3Q9ES97 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtn3Q9ES97 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rtn3Q9ES97 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rtn3Q9ES97 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rtn3Q9ES97 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rtn3Q9ES97 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rtn3Q9ES97 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rtn3Q9ES97 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rtn3Q9ES97 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rtn3Q9ES97 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rtn3Q9ES97 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rtn3Q9ES97 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rtn3Q9ES97 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rtn3Q9ES97 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rtn3Q9ES97 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rtn3Q9ES97 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rtn3Q9ES97 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtn3Q9ES97 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtn3Q9ES97 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtn3Q9ES97 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rtn3Q9ES97 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rtn3Q9ES97 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rtn3Q9ES97 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rtn3Q9ES97 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms