Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aph1cQ9DCZ9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aph1cQ9DCZ9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aph1cQ9DCZ9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aph1cQ9DCZ9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aph1cQ9DCZ9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aph1cQ9DCZ9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aph1cQ9DCZ9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aph1cQ9DCZ9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aph1cQ9DCZ9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aph1cQ9DCZ9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aph1cQ9DCZ9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aph1cQ9DCZ9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aph1cQ9DCZ9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aph1cQ9DCZ9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aph1cQ9DCZ9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aph1cQ9DCZ9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aph1cQ9DCZ9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aph1cQ9DCZ9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aph1cQ9DCZ9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aph1cQ9DCZ9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aph1cQ9DCZ9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aph1cQ9DCZ9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aph1cQ9DCZ9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aph1cQ9DCZ9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Aph1cQ9DCZ9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aph1cQ9DCZ9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aph1cQ9DCZ9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aph1cQ9DCZ9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aph1cQ9DCZ9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aph1cQ9DCZ9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aph1cQ9DCZ9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aph1cQ9DCZ9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aph1cQ9DCZ9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aph1cQ9DCZ9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aph1cQ9DCZ9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aph1cQ9DCZ9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Aph1cQ9DCZ9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aph1cQ9DCZ9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aph1cQ9DCZ9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aph1cQ9DCZ9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aph1cQ9DCZ9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aph1cQ9DCZ9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aph1cQ9DCZ9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aph1cQ9DCZ9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aph1cQ9DCZ9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aph1cQ9DCZ9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aph1cQ9DCZ9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aph1cQ9DCZ9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aph1cQ9DCZ9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aph1cQ9DCZ9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Aph1cQ9DCZ9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aph1cQ9DCZ9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aph1cQ9DCZ9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aph1cQ9DCZ9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aph1cQ9DCZ9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aph1cQ9DCZ9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aph1cQ9DCZ9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aph1cQ9DCZ9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aph1cQ9DCZ9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aph1cQ9DCZ9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Aph1cQ9DCZ9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Aph1cQ9DCZ9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Aph1cQ9DCZ9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Aph1cQ9DCZ9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aph1cQ9DCZ9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aph1cQ9DCZ9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aph1cQ9DCZ9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aph1cQ9DCZ9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aph1cQ9DCZ9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aph1cQ9DCZ9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aph1cQ9DCZ9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Aph1cQ9DCZ9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Aph1cQ9DCZ9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aph1cQ9DCZ9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aph1cQ9DCZ9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aph1cQ9DCZ9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aph1cQ9DCZ9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aph1cQ9DCZ9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aph1cQ9DCZ9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aph1cQ9DCZ9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Aph1cQ9DCZ9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Aph1cQ9DCZ9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aph1cQ9DCZ9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aph1cQ9DCZ9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aph1cQ9DCZ9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aph1cQ9DCZ9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aph1cQ9DCZ9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aph1cQ9DCZ9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aph1cQ9DCZ9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aph1cQ9DCZ9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aph1cQ9DCZ9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aph1cQ9DCZ9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aph1cQ9DCZ9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aph1cQ9DCZ9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aph1cQ9DCZ9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aph1cQ9DCZ9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aph1cQ9DCZ9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aph1cQ9DCZ9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aph1cQ9DCZ9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms