Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCV7

Krt7, Keratin, type II cytoskeletal 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt7Q9DCV7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt7Q9DCV7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt7Q9DCV7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt7Q9DCV7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt7Q9DCV7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt7Q9DCV7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt7Q9DCV7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt7Q9DCV7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt7Q9DCV7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt7Q9DCV7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt7Q9DCV7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt7Q9DCV7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt7Q9DCV7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt7Q9DCV7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt7Q9DCV7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt7Q9DCV7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt7Q9DCV7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt7Q9DCV7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt7Q9DCV7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt7Q9DCV7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt7Q9DCV7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt7Q9DCV7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt7Q9DCV7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt7Q9DCV7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt7Q9DCV7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt7Q9DCV7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Krt7Q9DCV7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Krt7Q9DCV7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Krt7Q9DCV7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Krt7Q9DCV7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt7Q9DCV7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt7Q9DCV7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt7Q9DCV7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt7Q9DCV7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt7Q9DCV7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt7Q9DCV7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt7Q9DCV7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt7Q9DCV7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt7Q9DCV7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt7Q9DCV7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt7Q9DCV7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt7Q9DCV7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt7Q9DCV7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt7Q9DCV7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt7Q9DCV7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt7Q9DCV7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt7Q9DCV7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt7Q9DCV7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt7Q9DCV7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt7Q9DCV7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt7Q9DCV7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt7Q9DCV7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt7Q9DCV7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt7Q9DCV7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt7Q9DCV7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt7Q9DCV7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt7Q9DCV7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt7Q9DCV7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt7Q9DCV7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt7Q9DCV7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt7Q9DCV7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt7Q9DCV7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt7Q9DCV7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt7Q9DCV7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Krt7Q9DCV7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt7Q9DCV7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt7Q9DCV7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt7Q9DCV7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt7Q9DCV7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt7Q9DCV7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt7Q9DCV7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt7Q9DCV7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt7Q9DCV7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt7Q9DCV7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt7Q9DCV7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt7Q9DCV7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt7Q9DCV7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt7Q9DCV7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt7Q9DCV7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt7Q9DCV7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krt7Q9DCV7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt7Q9DCV7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt7Q9DCV7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt7Q9DCV7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt7Q9DCV7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt7Q9DCV7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt7Q9DCV7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt7Q9DCV7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt7Q9DCV7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt7Q9DCV7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt7Q9DCV7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt7Q9DCV7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt7Q9DCV7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt7Q9DCV7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt7Q9DCV7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt7Q9DCV7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt7Q9DCV7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt7Q9DCV7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt7Q9DCV7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt7Q9DCV7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms