Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc97Q9DBT3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc97Q9DBT3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc97Q9DBT3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc97Q9DBT3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc97Q9DBT3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc97Q9DBT3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc97Q9DBT3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc97Q9DBT3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc97Q9DBT3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc97Q9DBT3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc97Q9DBT3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc97Q9DBT3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc97Q9DBT3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc97Q9DBT3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc97Q9DBT3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc97Q9DBT3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc97Q9DBT3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc97Q9DBT3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc97Q9DBT3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc97Q9DBT3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc97Q9DBT3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc97Q9DBT3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc97Q9DBT3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc97Q9DBT3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc97Q9DBT3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc97Q9DBT3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc97Q9DBT3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc97Q9DBT3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc97Q9DBT3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc97Q9DBT3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc97Q9DBT3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc97Q9DBT3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc97Q9DBT3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc97Q9DBT3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc97Q9DBT3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc97Q9DBT3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc97Q9DBT3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc97Q9DBT3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc97Q9DBT3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc97Q9DBT3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc97Q9DBT3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc97Q9DBT3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc97Q9DBT3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc97Q9DBT3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc97Q9DBT3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc97Q9DBT3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc97Q9DBT3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc97Q9DBT3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc97Q9DBT3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc97Q9DBT3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc97Q9DBT3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc97Q9DBT3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc97Q9DBT3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc97Q9DBT3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc97Q9DBT3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc97Q9DBT3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc97Q9DBT3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc97Q9DBT3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc97Q9DBT3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc97Q9DBT3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc97Q9DBT3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc97Q9DBT3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc97Q9DBT3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc97Q9DBT3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc97Q9DBT3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc97Q9DBT3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc97Q9DBT3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc97Q9DBT3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc97Q9DBT3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc97Q9DBT3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc97Q9DBT3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc97Q9DBT3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc97Q9DBT3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc97Q9DBT3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc97Q9DBT3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc97Q9DBT3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc97Q9DBT3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc97Q9DBT3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc97Q9DBT3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc97Q9DBT3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc97Q9DBT3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc97Q9DBT3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc97Q9DBT3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc97Q9DBT3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc97Q9DBT3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc97Q9DBT3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc97Q9DBT3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc97Q9DBT3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc97Q9DBT3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc97Q9DBT3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc97Q9DBT3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc97Q9DBT3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc97Q9DBT3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc97Q9DBT3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc97Q9DBT3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms