Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR4

Apbb2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb2Q9DBR4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apbb2Q9DBR4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apbb2Q9DBR4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apbb2Q9DBR4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apbb2Q9DBR4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apbb2Q9DBR4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apbb2Q9DBR4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apbb2Q9DBR4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apbb2Q9DBR4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apbb2Q9DBR4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apbb2Q9DBR4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apbb2Q9DBR4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apbb2Q9DBR4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apbb2Q9DBR4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Apbb2Q9DBR4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apbb2Q9DBR4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apbb2Q9DBR4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apbb2Q9DBR4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apbb2Q9DBR4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apbb2Q9DBR4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms