Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SrpraQ9DBG7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SrpraQ9DBG7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SrpraQ9DBG7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SrpraQ9DBG7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SrpraQ9DBG7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SrpraQ9DBG7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SrpraQ9DBG7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SrpraQ9DBG7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SrpraQ9DBG7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SrpraQ9DBG7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SrpraQ9DBG7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SrpraQ9DBG7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SrpraQ9DBG7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SrpraQ9DBG7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SrpraQ9DBG7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SrpraQ9DBG7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SrpraQ9DBG7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SrpraQ9DBG7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SrpraQ9DBG7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SrpraQ9DBG7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SrpraQ9DBG7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SrpraQ9DBG7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SrpraQ9DBG7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SrpraQ9DBG7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SrpraQ9DBG7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SrpraQ9DBG7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SrpraQ9DBG7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SrpraQ9DBG7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SrpraQ9DBG7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SrpraQ9DBG7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SrpraQ9DBG7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SrpraQ9DBG7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SrpraQ9DBG7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SrpraQ9DBG7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SrpraQ9DBG7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SrpraQ9DBG7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SrpraQ9DBG7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SrpraQ9DBG7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SrpraQ9DBG7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SrpraQ9DBG7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SrpraQ9DBG7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SrpraQ9DBG7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SrpraQ9DBG7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SrpraQ9DBG7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SrpraQ9DBG7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SrpraQ9DBG7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SrpraQ9DBG7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SrpraQ9DBG7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SrpraQ9DBG7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SrpraQ9DBG7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SrpraQ9DBG7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SrpraQ9DBG7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SrpraQ9DBG7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SrpraQ9DBG7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SrpraQ9DBG7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SrpraQ9DBG7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SrpraQ9DBG7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SrpraQ9DBG7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SrpraQ9DBG7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SrpraQ9DBG7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SrpraQ9DBG7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SrpraQ9DBG7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SrpraQ9DBG7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SrpraQ9DBG7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SrpraQ9DBG7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SrpraQ9DBG7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SrpraQ9DBG7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SrpraQ9DBG7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SrpraQ9DBG7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SrpraQ9DBG7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SrpraQ9DBG7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SrpraQ9DBG7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SrpraQ9DBG7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SrpraQ9DBG7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SrpraQ9DBG7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SrpraQ9DBG7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SrpraQ9DBG7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SrpraQ9DBG7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SrpraQ9DBG7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SrpraQ9DBG7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SrpraQ9DBG7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SrpraQ9DBG7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SrpraQ9DBG7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SrpraQ9DBG7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SrpraQ9DBG7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SrpraQ9DBG7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SrpraQ9DBG7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SrpraQ9DBG7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SrpraQ9DBG7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SrpraQ9DBG7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SrpraQ9DBG7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SrpraQ9DBG7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SrpraQ9DBG7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SrpraQ9DBG7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SrpraQ9DBG7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SrpraQ9DBG7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SrpraQ9DBG7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SrpraQ9DBG7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SrpraQ9DBG7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms