Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAQ7

3110070M22Rik, RIKEN cDNA 3110070M22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110070M22RikQ9DAQ7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3110070M22RikQ9DAQ7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3110070M22RikQ9DAQ7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110070M22RikQ9DAQ7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110070M22RikQ9DAQ7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110070M22RikQ9DAQ7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110070M22RikQ9DAQ7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
3110070M22RikQ9DAQ7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
3110070M22RikQ9DAQ7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
3110070M22RikQ9DAQ7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
3110070M22RikQ9DAQ7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
3110070M22RikQ9DAQ7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
3110070M22RikQ9DAQ7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
3110070M22RikQ9DAQ7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
3110070M22RikQ9DAQ7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
3110070M22RikQ9DAQ7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
3110070M22RikQ9DAQ7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
3110070M22RikQ9DAQ7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
3110070M22RikQ9DAQ7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
3110070M22RikQ9DAQ7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
3110070M22RikQ9DAQ7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
3110070M22RikQ9DAQ7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
3110070M22RikQ9DAQ7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
3110070M22RikQ9DAQ7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110070M22RikQ9DAQ7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110070M22RikQ9DAQ7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
3110070M22RikQ9DAQ7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
3110070M22RikQ9DAQ7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
3110070M22RikQ9DAQ7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
3110070M22RikQ9DAQ7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
3110070M22RikQ9DAQ7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
3110070M22RikQ9DAQ7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
3110070M22RikQ9DAQ7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
3110070M22RikQ9DAQ7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
3110070M22RikQ9DAQ7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
3110070M22RikQ9DAQ7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
3110070M22RikQ9DAQ7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
3110070M22RikQ9DAQ7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
3110070M22RikQ9DAQ7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
3110070M22RikQ9DAQ7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
3110070M22RikQ9DAQ7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
3110070M22RikQ9DAQ7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
3110070M22RikQ9DAQ7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
3110070M22RikQ9DAQ7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
3110070M22RikQ9DAQ7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
3110070M22RikQ9DAQ7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
3110070M22RikQ9DAQ7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
3110070M22RikQ9DAQ7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
3110070M22RikQ9DAQ7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
3110070M22RikQ9DAQ7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
3110070M22RikQ9DAQ7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
3110070M22RikQ9DAQ7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
3110070M22RikQ9DAQ7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
3110070M22RikQ9DAQ7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
3110070M22RikQ9DAQ7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
3110070M22RikQ9DAQ7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
3110070M22RikQ9DAQ7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
3110070M22RikQ9DAQ7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
3110070M22RikQ9DAQ7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
3110070M22RikQ9DAQ7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
3110070M22RikQ9DAQ7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms