Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N5

Cib4, Calcium and integrin-binding family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib4Q9D9N5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cib4Q9D9N5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cib4Q9D9N5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cib4Q9D9N5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cib4Q9D9N5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cib4Q9D9N5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cib4Q9D9N5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cib4Q9D9N5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cib4Q9D9N5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cib4Q9D9N5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cib4Q9D9N5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cib4Q9D9N5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cib4Q9D9N5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cib4Q9D9N5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cib4Q9D9N5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cib4Q9D9N5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cib4Q9D9N5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cib4Q9D9N5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cib4Q9D9N5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cib4Q9D9N5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cib4Q9D9N5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cib4Q9D9N5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cib4Q9D9N5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cib4Q9D9N5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cib4Q9D9N5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cib4Q9D9N5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cib4Q9D9N5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cib4Q9D9N5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cib4Q9D9N5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cib4Q9D9N5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cib4Q9D9N5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cib4Q9D9N5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cib4Q9D9N5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cib4Q9D9N5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cib4Q9D9N5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cib4Q9D9N5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cib4Q9D9N5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cib4Q9D9N5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cib4Q9D9N5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cib4Q9D9N5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cib4Q9D9N5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cib4Q9D9N5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cib4Q9D9N5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cib4Q9D9N5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cib4Q9D9N5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cib4Q9D9N5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cib4Q9D9N5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cib4Q9D9N5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cib4Q9D9N5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cib4Q9D9N5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cib4Q9D9N5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cib4Q9D9N5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cib4Q9D9N5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cib4Q9D9N5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cib4Q9D9N5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cib4Q9D9N5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cib4Q9D9N5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cib4Q9D9N5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cib4Q9D9N5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cib4Q9D9N5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cib4Q9D9N5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cib4Q9D9N5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cib4Q9D9N5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cib4Q9D9N5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cib4Q9D9N5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cib4Q9D9N5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cib4Q9D9N5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cib4Q9D9N5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cib4Q9D9N5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cib4Q9D9N5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cib4Q9D9N5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cib4Q9D9N5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cib4Q9D9N5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cib4Q9D9N5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cib4Q9D9N5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cib4Q9D9N5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cib4Q9D9N5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cib4Q9D9N5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cib4Q9D9N5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cib4Q9D9N5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cib4Q9D9N5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cib4Q9D9N5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cib4Q9D9N5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cib4Q9D9N5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cib4Q9D9N5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cib4Q9D9N5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cib4Q9D9N5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cib4Q9D9N5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cib4Q9D9N5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cib4Q9D9N5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cib4Q9D9N5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cib4Q9D9N5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cib4Q9D9N5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cib4Q9D9N5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cib4Q9D9N5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cib4Q9D9N5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cib4Q9D9N5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cib4Q9D9N5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cib4Q9D9N5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cib4Q9D9N5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms