Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9G4

1700080O16Rik, 1700080O16Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700080O16RikQ9D9G4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700080O16RikQ9D9G4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700080O16RikQ9D9G4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700080O16RikQ9D9G4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700080O16RikQ9D9G4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700080O16RikQ9D9G4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700080O16RikQ9D9G4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700080O16RikQ9D9G4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700080O16RikQ9D9G4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700080O16RikQ9D9G4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700080O16RikQ9D9G4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700080O16RikQ9D9G4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700080O16RikQ9D9G4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1700080O16RikQ9D9G4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700080O16RikQ9D9G4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
1700080O16RikQ9D9G4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700080O16RikQ9D9G4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700080O16RikQ9D9G4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700080O16RikQ9D9G4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
1700080O16RikQ9D9G4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
1700080O16RikQ9D9G4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700080O16RikQ9D9G4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700080O16RikQ9D9G4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700080O16RikQ9D9G4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700080O16RikQ9D9G4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700080O16RikQ9D9G4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700080O16RikQ9D9G4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700080O16RikQ9D9G4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
1700080O16RikQ9D9G4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700080O16RikQ9D9G4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700080O16RikQ9D9G4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700080O16RikQ9D9G4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700080O16RikQ9D9G4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700080O16RikQ9D9G4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700080O16RikQ9D9G4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700080O16RikQ9D9G4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700080O16RikQ9D9G4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700080O16RikQ9D9G4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700080O16RikQ9D9G4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700080O16RikQ9D9G4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700080O16RikQ9D9G4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700080O16RikQ9D9G4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700080O16RikQ9D9G4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700080O16RikQ9D9G4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700080O16RikQ9D9G4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700080O16RikQ9D9G4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700080O16RikQ9D9G4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700080O16RikQ9D9G4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700080O16RikQ9D9G4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700080O16RikQ9D9G4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
1700080O16RikQ9D9G4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700080O16RikQ9D9G4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700080O16RikQ9D9G4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700080O16RikQ9D9G4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700080O16RikQ9D9G4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700080O16RikQ9D9G4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700080O16RikQ9D9G4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700080O16RikQ9D9G4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700080O16RikQ9D9G4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700080O16RikQ9D9G4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700080O16RikQ9D9G4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700080O16RikQ9D9G4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700080O16RikQ9D9G4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700080O16RikQ9D9G4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700080O16RikQ9D9G4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
1700080O16RikQ9D9G4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700080O16RikQ9D9G4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700080O16RikQ9D9G4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700080O16RikQ9D9G4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700080O16RikQ9D9G4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700080O16RikQ9D9G4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700080O16RikQ9D9G4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700080O16RikQ9D9G4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700080O16RikQ9D9G4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
1700080O16RikQ9D9G4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
1700080O16RikQ9D9G4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
1700080O16RikQ9D9G4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700080O16RikQ9D9G4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700080O16RikQ9D9G4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700080O16RikQ9D9G4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700080O16RikQ9D9G4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700080O16RikQ9D9G4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700080O16RikQ9D9G4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700080O16RikQ9D9G4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700080O16RikQ9D9G4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700080O16RikQ9D9G4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700080O16RikQ9D9G4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700080O16RikQ9D9G4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700080O16RikQ9D9G4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700080O16RikQ9D9G4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700080O16RikQ9D9G4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700080O16RikQ9D9G4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700080O16RikQ9D9G4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700080O16RikQ9D9G4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700080O16RikQ9D9G4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700080O16RikQ9D9G4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
1700080O16RikQ9D9G4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700080O16RikQ9D9G4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700080O16RikQ9D9G4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700080O16RikQ9D9G4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms