Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx5Q9D8U8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx5Q9D8U8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx5Q9D8U8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx5Q9D8U8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx5Q9D8U8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx5Q9D8U8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx5Q9D8U8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx5Q9D8U8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx5Q9D8U8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx5Q9D8U8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx5Q9D8U8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx5Q9D8U8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx5Q9D8U8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx5Q9D8U8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx5Q9D8U8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx5Q9D8U8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx5Q9D8U8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx5Q9D8U8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx5Q9D8U8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx5Q9D8U8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx5Q9D8U8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx5Q9D8U8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx5Q9D8U8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx5Q9D8U8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx5Q9D8U8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx5Q9D8U8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx5Q9D8U8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx5Q9D8U8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx5Q9D8U8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx5Q9D8U8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx5Q9D8U8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx5Q9D8U8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx5Q9D8U8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx5Q9D8U8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx5Q9D8U8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx5Q9D8U8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx5Q9D8U8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx5Q9D8U8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx5Q9D8U8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx5Q9D8U8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx5Q9D8U8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx5Q9D8U8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx5Q9D8U8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx5Q9D8U8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx5Q9D8U8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx5Q9D8U8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx5Q9D8U8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx5Q9D8U8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx5Q9D8U8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx5Q9D8U8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx5Q9D8U8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx5Q9D8U8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx5Q9D8U8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx5Q9D8U8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx5Q9D8U8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx5Q9D8U8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx5Q9D8U8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx5Q9D8U8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx5Q9D8U8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx5Q9D8U8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx5Q9D8U8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx5Q9D8U8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx5Q9D8U8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx5Q9D8U8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx5Q9D8U8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx5Q9D8U8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx5Q9D8U8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx5Q9D8U8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx5Q9D8U8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx5Q9D8U8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx5Q9D8U8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx5Q9D8U8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx5Q9D8U8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx5Q9D8U8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx5Q9D8U8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx5Q9D8U8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx5Q9D8U8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx5Q9D8U8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx5Q9D8U8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx5Q9D8U8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx5Q9D8U8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx5Q9D8U8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx5Q9D8U8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx5Q9D8U8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx5Q9D8U8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx5Q9D8U8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx5Q9D8U8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snx5Q9D8U8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snx5Q9D8U8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx5Q9D8U8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx5Q9D8U8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx5Q9D8U8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx5Q9D8U8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx5Q9D8U8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx5Q9D8U8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx5Q9D8U8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx5Q9D8U8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx5Q9D8U8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx5Q9D8U8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms