Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabra4Q9D6F4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gabra4Q9D6F4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gabra4Q9D6F4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gabra4Q9D6F4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabra4Q9D6F4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabra4Q9D6F4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabra4Q9D6F4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabra4Q9D6F4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabra4Q9D6F4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabra4Q9D6F4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gabra4Q9D6F4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gabra4Q9D6F4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabra4Q9D6F4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabra4Q9D6F4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabra4Q9D6F4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabra4Q9D6F4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabra4Q9D6F4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabra4Q9D6F4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabra4Q9D6F4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabra4Q9D6F4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabra4Q9D6F4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabra4Q9D6F4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gabra4Q9D6F4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gabra4Q9D6F4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabra4Q9D6F4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabra4Q9D6F4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabra4Q9D6F4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabra4Q9D6F4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabra4Q9D6F4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabra4Q9D6F4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabra4Q9D6F4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabra4Q9D6F4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabra4Q9D6F4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabra4Q9D6F4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabra4Q9D6F4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabra4Q9D6F4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabra4Q9D6F4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabra4Q9D6F4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabra4Q9D6F4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabra4Q9D6F4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabra4Q9D6F4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabra4Q9D6F4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabra4Q9D6F4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabra4Q9D6F4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabra4Q9D6F4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabra4Q9D6F4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabra4Q9D6F4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabra4Q9D6F4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabra4Q9D6F4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabra4Q9D6F4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabra4Q9D6F4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabra4Q9D6F4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabra4Q9D6F4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabra4Q9D6F4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabra4Q9D6F4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabra4Q9D6F4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabra4Q9D6F4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabra4Q9D6F4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabra4Q9D6F4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabra4Q9D6F4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabra4Q9D6F4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabra4Q9D6F4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabra4Q9D6F4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabra4Q9D6F4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabra4Q9D6F4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gabra4Q9D6F4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gabra4Q9D6F4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gabra4Q9D6F4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gabra4Q9D6F4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gabra4Q9D6F4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gabra4Q9D6F4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gabra4Q9D6F4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabra4Q9D6F4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gabra4Q9D6F4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabra4Q9D6F4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gabra4Q9D6F4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabra4Q9D6F4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabra4Q9D6F4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabra4Q9D6F4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabra4Q9D6F4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gabra4Q9D6F4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabra4Q9D6F4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabra4Q9D6F4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabra4Q9D6F4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gabra4Q9D6F4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gabra4Q9D6F4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gabra4Q9D6F4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gabra4Q9D6F4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabra4Q9D6F4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabra4Q9D6F4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabra4Q9D6F4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabra4Q9D6F4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabra4Q9D6F4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabra4Q9D6F4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabra4Q9D6F4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabra4Q9D6F4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabra4Q9D6F4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabra4Q9D6F4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabra4Q9D6F4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms